Os trabalhos arqueológicos são todos os trabalhos que seguem métodos arqueológicos de investigação: tanto as escavações, como as acções de prospecção. Genericamente, podemos observar que os estudos arqueológicos de Vila de Rei, se encontram ainda numa fase bastante preliminar. A detecção e identificação destes 68 sítios arqueológicos, não os torna nos únicos existentes. Não podemos compreendê-los como um núcleo fechado, dado que com novas acções de prospecção, ou mesmo através de achados ocasionais, é possível ir inserindo novos sítios arqueológicos detectados por estas acções.
InvestigaçãoPodemos considerar que o ano de 1995 marca o início da pesquisa e investigação arqueológica no Concelho de Vila de Rei, com o Projecto dos Arqueólogos Carlos Batata e Filomena Gaspar, “A Idade do Ferro no Médio e Baixo Zêzere”, desenvolvido em alguns Concelhos desta área. Um primeiro momento desta investigação preliminar tinha como objectivo a obtenção de um inventário geral dos sítios arqueológicos existentes no Concelho, que culminou na publicação da obra do “Levantamento Arqueológico do Concelho de Vila de Rei” (2000).
Entre 1995 e 1996, foram desenvolvidos por estes arqueólogos os trabalhos arqueológicos de sondagem no sítio do Cerro do Castelo. Já em 1998, os Arqueólogos voltaram à área de jurisdição do município, para desenvolvimento de acções de prospecção e levantamento, no âmbito do PNTA/98 “O Final da Idade do Bronze e a transição para a Idade do Ferro no Ribatejo Norte”. Já em 2001 e 2002, o Arqueólogo Carlos Batata incidiu os seus esforços de identificação de sítios e melhor classificação das Conheiras, que se inseriram na sua tese de Mestrado “A Idade do Ferro e Romanização entre os rios Zêzere, Tejo e Ocreza” (2002).
Já em 2004, a Arqueóloga Ana Rita Ferreira desenvolveu novas prospecções, que tentaram desenvolver o conhecimento dos sítios arqueológicos pré-históricos no Concelho de Vila de Rei. No final do estágio curricular realizado pela mesma, tinham sido desenvolvidos três trabalhos. Um primeiro relativo à execução de uma base de dados do espólio lítico recolhido. Os outros dois trabalhos foram os processos de classificação de património imóvel: da «Casa Xavier» (Fundada) e das «Conheiras de Vila de Rei». No entanto, qualquer um dos dois não pode avançar por falta de dados, tais como: fotografias, levantamentos topográficos, dados bibliográficos, etc… Trabalho este bastante difícil de executar em apenas três meses de permanência da profissional.
Por estes e outros motivos, em 2005 a Arqueóloga Teresa Rita Pereira desenvolve um estágio profissional, que visava exactamente incidir sobre esses processos de Classificação Patrimonial de Imóveis. Deste modo foram desenvolvidos alguns trabalhos desde Julho de 2005 até ao presente momento:
- Actualização da Base de Dados Endovélico (IPA) – que passou a ter um inventário mais actualizado dos sítios arqueológicos, passando de 3 para 66 sítios (concluído);
- Alteração dos sítios arqueológicos inseridos no “Plano de Ordenamento da Albufeira do Castelo de Bode” (POACB) – foi enviado um novo inventário, com novos sítios arqueológicos identificados e que se encontram geograficamente inseridos no POACB, não devendo por isso ser afectados por quaisquer trabalhos intrusivos no subsolo. Na verdade aos dezasseis (16) sítios integrados no Anexo I, do Artigo 9.º, alínea 2) do Decreto-Lei n.º 108/03 de 10 de Maio, vieram juntar-se com a Tese de Mestrado do Dr. Carlos Batata (2002) mais 8 sítios arqueológicos inseridos neste Plano. Para além disso surgiram ainda os topónimos correctos para todas estas realidades individuais, em especial no caso das Conheiras (à espera de parecer e publicação pelo INAG);
- Execução da «Carta Arqueológica de Vila de Rei» á escala 1: 25 000 (concluído);
- Execução da «Carta Geológica do Concelho de Vila de Rei» à escala 1: 50 000 com inserção dos sítios arqueológicos do Concelho (concluído);
- Trabalho de Investigação da «Carta Arqueológica de Vila de Rei», que complemente o estudo integrado no “Levantamento Arqueológico do Concelho de Vila de Rei” de Carlos Batata (em execução e actualização contínua);
- Proposta de Sinalização dos Sítios Arqueológicos de Vila de Rei, com sinalética apropriada em placas de madeira, um pouco à semelhança dos percursos pedestres (em execução);
- Processo de Classificação Patrimonial do sítio arqueológico do Cerro do Castelo (Seada) como “Sítio de Interesse Nacional/ Público” (concluído; aguarda parecer do IPPAR/ IPA/ IGESPAR); 
- Processo de Classificação Patrimonial do Conjunto de interesse geo-arqueológico das 44 Conheiras de Vila de Rei, como “Conjunto de Interesse Nacional/ Público” (concluído; aguarda parecer do IPPAR/ IPA/ IGESPAR);
- Processo de Classificação Patrimonial do Imóvel da “Casa Xavier” (Fundada), como “Imóvel de Interesse Municipal” (concluído; aprovado);
Trabalhos práticos
- Escavações de Emergência no Adro da Igreja Matriz Velha de Vila de Rei no âmbito das Obras de Requalificação Urbana do Centro Histórico de Vila de Rei (Novembro de 2005 a Agosto de 2006): pretendia-se a salvaguarda pelo registo e também a aferição da real importância deste sítio arqueológico. Esta aferição efectuou-se através de duas sondagens prévias de 4 X 4 m ., tendo sido concluído que os enterramentos tanto da Necrópole do século XIV-XVI, como os do Cemitério Histórico datado entre 1818 e 1918, se encontravam a baixas profundidades. Deste modo, seria impossível prosseguir com os trabalhos de Requalificação Urbana que estavam programados para o local. Deste modo, terá de se desenvolver um plano de pormenor arquitectónico para a área que preveja a existência destas realidades.
Outras duas áreas, o Alçado Este e o Alçado Oeste foram intervencionados de emergência, dada a necessidade premente e efectiva da sua total afectação. Em ambos os locais, surgiram novas sepulturas escavadas no afloramento rochoso, datadas entre o século XIV e XVI (concluído;aprovado).
- Acompanhamento de Obras de Requalificação Urbana do Centro Histórico de Vila de Rei (Novembro de 2005 até Outubro de 2006): foi numa destas acções, que foram detectados os materiais osteológicos junto ao Adro da Igreja Matriz Velha (concluído; aprovado).
- Prospecções Arqueológicas na área de jurisdição do Concelho de Vila de Rei (Setembro de 2005 a Setembro de 2006): nestas acções pretendia-se averiguar a existência de novos sítios arqueológicos, bem como datar mais especificamente, alguns daqueles anteriormente referenciados, mas sem qualquer tipo de cronologias propostas e por isso classificados como de cronologia indeterminada. De modo, a possibilitar a detecção de metais em locais de difícil acesso, foi solicitado ao IPA um pedido de autorização de detector de metais, por parte da Arqueóloga Teresa Rita Pereira. Os trabalhos permitiram a detecção de 11 novos sítios arqueológicos, sendo que destes, apenas as conheiras se encontram já inseridas na base de dados. 
Os outros sítios serão posteriormente inseridos, após o envio do Relatório Final destes trabalhos para o IPA/ IGESPAR (concluído; aprovado).
- Levantamento Topográfico à escala 1: 2000 das “Conheiras” de Vila de Rei: com o apoio do Gabinete de Apoio Técnico da Sertã (Sr. Luís Santos Silva), foi possível proceder ao levantamento topográfico de 16 “Conheiras” à escala 1: 2000, o que permitiu não só compreender melhor as dinâmicas dos locais, como também permitiu a instauração do processo de classificação das mesmas (16 concluídas e 29 por realizar).
- Acompanhamento de Obra do Estradão Florestal Marginal à Albufeira do Castelo de Bode (Janeiro de 2006 a Agosto de 2007): nomeadamente da destruição parcial de algumas “conheiras”, como a da Chã dos Solteiros (Macieira) (relatório final em execução).
- Acompanhamento de Obra da Estrada de Ligação entre São Martinho e Arrancoeira com ligação à Malhada (Abril de 2006 a Setembro de 2006): nomeadamente da destruição parcial da Conheira das Obradas (Malhada) e da Conheira da Arrancoeira (Arrancoeira)(concluído; relatório final aprovado pelo IPA).